К моменту возвращения в Москву университет объединял одиннадцать факультетов (130 кафедр), в том числе по филологическому факультету: кафедра русского языка, общего и сравнительного языкознания, славянской филологии, романо-германской филологии, французского языка, английского языка (для филологического факультета), английского языка (для факультетов университета), немецкого языка, классической филологии, тюркской филологии, арабской филологии, иранской филологии, истории русской литературы, истории общей литературы, советской литературы, фольклора, русского искусствоведения, общего искусствоведения. В 1943 г. на факультете было открыто восточное отделение во главе с известным ученым-востоковедом Н. К. Дмитриевым, который одновременно заведовал кафедрой тюркской филологии. В состав отделения вошла кафедра иранской филологии (зав. кафедрой - Б. В. Миллер) и созданная в 1944 г. кафедра арабской филологии (зав. кафедрой - Б. М. Гранде). В 1953 г. была создана кафедра китайской филологии. Основной задачей отделения стала подготовка кадров востоковедов на широкой филологической основе.

Позже, в 1956 г., на базе восточного отделения филологического факультета и восточного отделения исторического факультета при Московском университете был создан Институт восточных языков (ИВЯ), в последующем - Институт стран Азии и Африки.

Развивая идеи МИФЛИ, на филологическом факультете до 1950 г. продолжало работать отделение искусствознания, в которое входили две кафедры - русского искусства (зав. кафедрой сначала М. В. Алпатов, затем недолго И. Э. Грабарь, с 1948 г. - А. А. Федоров-Давыдов) и общего искусствознания (зав. кафедрой - Б. Р. Виппер). В 1950 г. это отделение приказом по университету было введено в структуру исторического факультета.

В 1947 г. на факультете было основано отделение журналистики. Опыт работы отделения, создание учебных планов, обеспечивающих подготовку современного журналиста, развитая система специализации на основе фундаментальной историко-филологической образовательной базы - все это позволило в 1952 г. поставить вопрос об организации в МГУ факультета журналистики как самостоятельной структурной единицы.

Давая жизнь новым факультетам, институтам, отделениям, филологический факультет развивался сам, совершенствовался учебный процесс, создавались новые кафедры, отделения, лаборатории, улучшалось техническое обеспечение учебного процесса и научно-исследовательских работ. Во второй половине века на факультете начинается расширение традиционных специальностей, вводятся новые специальности и специализации. Создается лаборатория устной речи, первым заведующим которой стал известный специалист в области общего языкознания проф. Александр Александрович Реформатский. В 1962 г. бы ли организованы кафедра и отделение структурной и прикладной лингвистики (ныне - отделение теоретической и прикладной лингвистики). Основателем и первым руководителем этого отделения был Владимир Андреевич Звегинцев (ныне - проф. Александр Евгеньевич Кибрик). В процессе развертывания традиционных специальностей на факультете возникают кафедры романского языкознания (зав. кафедрой - проф. Рубен Александрович Будагов, ныне - проф. Марина Афанасьевна Косарик), германского языкознания (зав. кафедрой - проф. Николай Сергеевич Чемоданов, позже - проф. Нинель Ильинична Филичева, ныне - Елена Михайловна Чекалина), общего и сравнительно-исторического языкознания (зав. кафедрой - проф. Юрий Сергеевич Степанов, позже - проф. Юрий Владимирович Рождественский, ныне - проф. Александр Александрович Волков), иберо-романского языкознания (зав. кафедрой - проф. Венедикт Степанович Виноградов, ныне - Ольга Максимовна Мунгалова), угро-финской филологии (зав. кафедрой - проф. Ариадна Ивановна Кузнецова; ныне кафедра как самостоятельное подразделение не существует). С организацией этих кафедр начался процесс подготовки студентов по так называемым «редким» языкам - норвежскому, шведскому, датскому, каталанскому, португальскому и др. Для обеспечения учебного процесса и для исследовательской работы над новыми научными проблемами в конце 1960-х - 1970-е гг. развернулось издание учебных пособий для студентов. В частности, выходили книги серии «Языки мира», содержавшие грамматический очерк соответствующего языка, хрестоматию и словарь.

В системе литературоведческих кафедр существенное место заняла кафедра теории литературы, созданная и руководимая многие годы Геннадием Николаевичем Поспеловым.

В послевоенные годы параллельно кафедре истории советской литературы была образована кафедра истории литератур народов СССР, объединенная в 1964 г. с кафедрой истории советской литературы.

В начале 1960-х гг. на факультете началась работа по составлению этимологического словаря русского языка, для чего в структуру факультета был введен кабинет этимологического словаря (ныне - лаборатория этимологических исследований). До 1987 г. его работой руководил проф. Николай Максимович Шанский, затем - проф. Георгий Александрович Хабургаев, академик Никита Ильич Толстой, ныне - Анатолий Федорович Журавлев (с 1993 г.). Кроме подготовки очередных томов словаря, лаборатория издает сборники «Этимологических исследований», выпускает словари иностранных слов и др.

В 1963 г. Приказом Минвуза СССР была открыта лаборатория фонетики и речевой коммуникации (руководитель - проф. Любовь Владимировна Златоустова). Основными направлениями деятельности лаборатории являются автоматическое распознавание и синтез речи, формирование лингвистических баз данных, формализация речевого сигнала с целью создания компьютерных учебников, исследование проблем восприятия и понимания речи, изучение психолингвистических аспектов понимания и восприятия речи. В результате деятельности лаборатории были разработаны три государственных стандарта по проверке каналов радиотелефонной связи, созданы базы данных и базы знаний, позволяющие решать задачи коррекции произносительной нормы, определять степень отклонения речи говорящего от норматива, проводить фоноскопические экспертизы по идентификации и верификации речи говорящего и др.

В 1972 г. при филологическом факультете образовалось отделение по преподаванию русского языка как иностранного, в состав которого входили две кафедры: одна из них занималась обучением иностранных учащихся естественных факультетов (зав. кафедрой - Марина Леонтьевна Ремнёва), другая - преподаванием русского языка в группах иностранных учащихся гуманитарных факультетов (зав. кафедрой - Галина Ивановна Дергачева). Заведующей отделением была назначена проф. Клавдия Васильевна Горшкова, зав. кафедрой русского языка филологического факультета. В 1992 г. кафедры вошли в состав филологического факультета.

С ноября 1946 г. факультет издает свой научный журнал - «Филология» (9-я серия «Вестника Московского университета»), с середины 1990-х гг. регулярно выходят «Научные док лады филологического факультета», возобновляется выпуск сборников «Вопросы русского языкознания», организуются повременные издания кафедры германского языкознания («Атлантика»), кафедры английского языкознания, кафедры славянской филологии и др.